Безпосереднє керівництво Державною спеціальною службою транспорту в мирний час та в особливий період здійснює орган управління Державною спеціальною службою транспорту в системі Міністерства оборони України.
Безпосереднє керівництво Державною спеціальною службою транспорту здійснює керівник головного органу військового управління Державної спеціальної служби транспорту, який підпорядковується Міністру оборони України.
{Частина перша статті 11 із змінами, внесеними згідно із Законами № 1414-VI від 02.06.2009 , № 5502-VI від 20.11.2012 ; в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
Безпосереднє керівництво Державною спеціальною службою транспорту - це діяльність, що спрямована на здійснення заходів щодо розвитку Державної спеціальної служби транспорту, її технічного оснащення, підготовки та всебічного забезпечення, визначення основ її застосування, а також управління нею під час виконання завдань.
Керівник органу управління Державною спеціальною службою транспорту користується щодо підлеглих військовослужбовців дисциплінарною владою командувача виду Збройних Сил України в обсязі, визначеному Дисциплінарним статутом Збройних Сил України.
Керівник головного органу військового управління Державної спеціальної служби транспорту має першого заступника та заступників, які належать до вищого командування Державної спеціальної служби транспорту.
{Частина друга статті 11 із змінами, внесеними згідно із Законом № 5502-VI від 20.11.2012 ; в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
Керівник головного органу військового управління Державної спеціальної служби транспорту, перший заступник та заступники керівника головного органу військового управління Державної спеціальної служби транспорту призначаються на посаду та звільняються з посади Президентом України за поданням Міністра оборони України.
Керівник органу управління Державною спеціальною службою транспорту та його заступники призначаються на посаду та звільняються з посади Президентом України за поданням Міністра оборони України.
Завдання і функції головного органу військового управління Державної спеціальної служби транспорту визначаються положенням, що затверджується Президентом України.
{Частина статті 11 в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
{Стаття 11 із змінами, внесеними згідно із Законами № 1414-VI від 02.06.2009 , № 5502-VI від 20.11.2012 , № 2225-VIII від 05.12.2017 ; в редакції Закону № 4631-IX від 09.10.2025 }
Функції і повноваження органу управління та його керівника визначаються Положенням про Державну спеціальну службу транспорту.