Система функціонування ФОН передбачає:
укладення емітентом сертифікатів ФОН угоди із забудовником;
залучення коштів шляхом випуску та розміщення сертифікатів ФОН;
інвестування залучених коштів в операції з нерухомістю;
укладення емітентом угоди з управителем ФОН у разі передачі функцій управління майном іншій фінансовій установі згідно з вимогами цього Закону;
організацію спорудження забудовником об'єктів будівництва відповідно до наданої за угодою документації;
здійснення управителем ФОН контролю за цільовим використанням забудовником спрямованих на будівництво коштів;
здійснення управителем ФОН нагляду за ходом будівництва;
проведення реєстрації права власності на нерухомість, набуту від здійснення управління ФОН на ім'я управителя ФОН, який діє як довірчий власник;
страхування нерухомості, набутої від здійснення управління ФОН;
страхування фінансової відповідальності управителя ФОН;
здійснення управителем управління ФОН та отримання доходу на умовах Правил ФОН;
розподіл управителем доходу від управління ФОН між власниками сертифікатів ФОН;
викуп сертифікатів ФОН у власників після закінчення строку, на який був створений відповідний ФОН.