Керівник секретаріату Національного агентства:
1) від імені Національного агентства укладає договори, вчиняє інші правочини, представляє інтереси в цивільно-правових відносинах, у судах України та в інших органах державної влади, установах, організаціях;
2) здійснює заходи щодо державної реєстрації Національного агентства відповідно до Закону України “Про державну реєстрацію юридичних осіб, фізичних осіб — підприємців та громадських формувань”;
3) скликає засідання Національного агентства за вмотивованою вимогою не менш як однієї третини його складу за умови нескликання засідання Головою або його заступниками протягом семи календарних днів відповідно до вимог, передбачених цим Статутом;
4) організовує та контролює виконання секретаріатом Національного агентства Конституції та законів України, актів Президента України, Кабінету Міністрів України, інших актів законодавства;
5) приймає на роботу на умовах строкового трудового договору і звільняє з роботи в порядку, передбаченому законодавством про працю, працівників секретаріату Національного агентства, приймає рішення щодо їх заохочення, притягнення до дисциплінарної відповідальності;
6) видає обов’язкові до виконання працівниками секретаріату Національного агентства накази та доручення з питань, що належать до його компетенції;
7) приймає рішення про відрядження, зокрема за кордон, заступників керівника секретаріату і працівників секретаріату Національного агентства;
8) виконує інші функції, пов’язані із забезпеченням діяльності секретаріату Національного агентства.