Організацію та проведення конкурсного відбору членів Національного агентства здійснює Конкурсна комісія, яка утворюється Кабінетом Міністрів України як дорадчий орган та діє на підставі Положення про Конкурсну комісію з відбору членів Національного агентства із забезпечення якості вищої освіти, що затверджується Кабінетом Міністрів України.
Члени Національного агентства виконують покладені на них функції на підставі укладених з ними цивільно-правових договорів, крім Голови та заступників Голови Національного агентства, які працюють на постійній основі.
Порядок проведення конкурсу щодо обрання членів Національного агентства відбувається відповідно до Положення про конкурс щодо обрання членів Національного агентства із забезпечення якості вищої освіти, що затверджується Кабінетом Міністрів України.
Члени Національного агентства та члени галузевих експертних рад на час виконання обов’язків, покладених на них Законом України “Про вищу освіту”, можуть бути звільнені (повністю або частково) від виконання професійних обов’язків за основним місцем роботи із збереженням заробітної плати.
Галузеві експертні ради Національного агентства не мають статусу юридичної особи та діють на підставі положення про них.