Організацію та проведення конкурсного відбору членів Національного агентства здійснює Конкурсна комісія, яка утворюється Кабінетом Міністрів України як дорадчий орган та діє на підставі Положення про Конкурсну комісію з відбору членів Національного агентства із забезпечення якості вищої освіти, що затверджується Кабінетом Міністрів України.
Порядок проведення конкурсу щодо обрання членів Національного агентства відбувається відповідно до Положення про конкурс щодо обрання членів Національного агентства із забезпечення якості вищої освіти, що затверджується Кабінетом Міністрів України.