Державна спеціальна служба транспорту має таку загальну структуру:
орган управління Державною спеціальною службою транспорту в системі Міністерства оборони України;
головний орган військового управління;
{Абзац другий частини першої статті 4 із змінами, внесеними згідно із Законом № 5502-VI від 20.11.2012 ; в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
регіональні органи військового управління;
бригади, полки, окремі батальйони;
військові частини;
{Абзац третій частини першої статті 4 в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
навчальні військові частини;
підрозділи охорони;
військові навчальні підрозділи закладів вищої освіти;
органи забезпечення;
підприємства, установи та організації.
навчальний центр;
Організаційно Державна спеціальна служба транспорту складається з органів військового управління, військових частин, навчальних військових частин, військових навчальних підрозділів закладів вищої освіти, підприємств, установ та організацій.
заклади, підприємства та установи.
Положення про головний орган військового управління Державної спеціальної служби транспорту затверджується Президентом України. Положення про органи військового управління, військові частини, навчальні військові частини, військові навчальні підрозділи закладів вищої освіти, підприємства, установи та організації Державної спеціальної служби транспорту затверджуються керівником головного органу військового управління Державної спеціальної служби транспорту.
У структурних підрозділах Державної спеціальної служби транспорту можуть утворюватися воєнізована охорона та сторожова охорона.
{Частина друга статті 4 в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
Загальна чисельність Державної спеціальної служби транспорту становить 5000 осіб, у тому числі 4600 військовослужбовців. У разі необхідності чисельність Державної спеціальної служби транспорту може бути збільшена відповідним законом.
{Частина статті 4 в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
В особливий період чисельність Державної спеціальної служби транспорту збільшується на кількість особового складу, призваного на військову службу на виконання указів Президента України про мобілізацію, затверджених законами України.
{Частина статті 4 в редакції Закону № 2225-VIII від 05.12.2017 }
Місця розташування на території України всіх структурних підрозділів Державної спеціальної служби транспорту визначаються Президентом України за поданням Міністерства оборони України, погодженим з Генеральним штабом Збройних Сил України та відповідними органами місцевого самоврядування.
{Частина п'ята статті 4 із змінами, внесеними згідно із Законом № 2225-VIII від 05.12.2017 }
Гранична чисельність особового складу головного органу військового управління Державної спеціальної служби транспорту затверджується Президентом України за поданням Міністерства оборони України, погодженим з Генеральним штабом Збройних Сил України.
Гранична чисельність особового складу органу управління Державною спеціальною службою транспорту затверджується Президентом України за поданням Міністерства оборони України, погодженим з Генеральним штабом Збройних Сил України.
Головний орган військового управління, регіональні органи військового управління, військові частини, навчальні військові частини, військові навчальні підрозділи закладів вищої освіти, підприємства, установи та організації Державної спеціальної служби транспорту є юридичними особами, мають печатку із зображенням Державного Герба України та своїм найменуванням, інші печатки і штампи, рахунки в банках, у тому числі в іноземній валюті.
{Частина шоста статті 4 із змінами, внесеними згідно із Законом № 2225-VIII від 05.12.2017 }
Створення, реорганізація і ліквідація регіональних органів військового управління, військових частин, навчальних військових частин, підприємств, установ та організацій Державної спеціальної служби транспорту в межах загальної чисельності та виділених коштів Державного бюджету України здійснюються за рішенням Міністра оборони України.
Орган управління Державною спеціальною службою транспорту, бригади, полки, окремі батальйони, підрозділи охорони, органи забезпечення, навчальний центр, заклади, підприємства та установи, що входять до складу Державної спеціальної служби транспорту, є юридичними особами, мають печатку із зображенням Державного Герба України та своїм найменуванням, інші печатки і штампи, рахунки в банках, у тому числі в іноземній валюті.
{Стаття 4 із змінами, внесеними згідно із Законами № 5502-VI від 20.11.2012 , № 2225-VIII від 05.12.2017 ; в редакції Закону № 4631-IX від 09.10.2025 }
{Частина сьома статті 4 із змінами, внесеними згідно із Законом № 2225-VIII від 05.12.2017 }