До відання Міністерства охорони навколишнього природного середовища спеціально уповноваженого центрального органу виконавчої влади з питань екології та ядерної безпеки України природних ресурсів в галузі управління і контролю за використанням і охороною вод та відтворенням водних ресурсів належить:
1) здійснення комплексного управління в галузі охорони водних ресурсів, проведення єдиної науково-технічної політики з питань використання і охорони вод та відтворення водних ресурсів, координація діяльності міністерств, відомств, підприємств, установ та організацій в цій галузі;
2) здійснення державного контролю за використанням і охороною вод та відтворенням водних ресурсів;
3) розробка та участь у реалізації державних, міждержавних та регіональних програм використання і охорони вод та відтворення водних ресурсів;
4) організація та здійснення державного моніторингу вод;
5) розробка і затвердження нормативів і правил, участь у розробці стандартів щодо регулювання використання і охорони вод та відтворення водних ресурсів в межах своєї компетенції;
6) здійснення державної екологічної експертизи;
7) видача дозволів на спеціальне водокористування в разі використання води з водних об'єктів загальнодержавного значення;
8) прийняття у встановленому порядку рішень про обмеження, тимчасову заборону (зупинення) чи припинення діяльності підприємств, установ, організацій і об'єктів в разі порушення ними вимог водного законодавства;
9) розробка і запровадження у встановленому порядку організаційно-економічних заходів щодо забезпечення охорони і використання вод та відтворення водних ресурсів;
10) здійснення міжнародного співробітництва з питань використання і охорони вод та відтворення водних ресурсів;
11) вирішення інших питань у галузі використання і охорони вод та відтворення водних ресурсів.