Основною структурною одиницею Інституту є відділ.
Діяльність Інституту не повинна негативно впливати на умови роботи інших установ, організацій, підприємств, побутові умови громадян, які проживають на прилеглих до нього територіях. Інститут вживає необхідних заходів щодо охорони довкілля, збереження його від забруднення викидами, стічними водами та іншими відходами, а також щодо боротьби з шумами, які перевищують допустимі рівні, та радіоперешкодами.
Інститут може утворювати філіали в інших містах України.
На базі Інституту може бути утворено науково-дослідні центри з найбільш актуальних проблем суспільного розвитку, а за рішенням директора на базі Інституту та його філіалів - дослідницькі та робочі групи.
Самостійним структурним підрозділом Інституту є Центр досліджень проблем Російської Федерації, основними завданнями якого є:
{Пункт 15 доповнено абзацом згідно з Указом Президента № 656/2015 від 24.11.2015 }
дослідження ключових аспектів та проблем внутрішнього розвитку Російської Федерації, її економічних, фінансових, військових, інтелектуальних, інформаційних та політичних ресурсів, аналіз її зовнішньополітичної діяльності і тенденцій у міждержавних відносинах з Україною;
{Пункт 15 доповнено абзацом згідно з Указом Президента № 656/2015 від 24.11.2015 }
аналіз і оцінка проблем і перспектив реалізації національних інтересів та забезпечення національної безпеки України у сферах внутрішньої і зовнішньої політики у контексті взаємовідносин з Російською Федерацією, підготовка для внесення в установленому порядку на розгляд Президентові України, Раді національної безпеки і оборони України відповідних пропозицій;
{Пункт 15 доповнено абзацом згідно з Указом Президента № 656/2015 від 24.11.2015 }
опрацювання питань українсько-російських відносин в рамках супроводження Інститутом проектів щорічних послань Президента України до Верховної Ради України про внутрішнє і зовнішнє становище України.
{Пункт 15 доповнено абзацом згідно з Указом Президента № 656/2015 від 24.11.2015 }
{Пункт 15 - 1 виключено на підставі Указу Президента № 471/2010 від 02.04.2010 }