До компетенції Головної державної інспекції захисту рослин спеціально уповноваженого центрального органу виконавчої влади з питань аграрної політики належить:
керівництво державними станціями захисту рослин Автономної Республіки Крим, областей і районів, спеціалізованими територіальними лабораторіями;
участь у розробленні загальнодержавних і міждержавних цільових програм захисту рослин;
організація розроблення та здійснення регіональних цільових програм захисту рослин;
впровадження інтегрованої системи захисту рослин;
визначення асортименту та обсягів виробництва засобів захисту рослин вітчизняною промисловістю, координація закупівлі їх за імпортом;
організація та здійснення державного контролю за своєчасним проведенням підприємствами, установами, організаціями усіх форм власності та громадянами заходів щодо захисту рослин, додержанням регламентів застосування засобів захисту рослин; ( Абзац сьомий частини першої статті 12 із змінами, внесеними згідно із Законом N 1628-IV ( 1628-15 ) від 18.03.2004 )
погодження асортименту засобів захисту рослин, технічних умов їх виробництва і застосування, плану державних випробувань і реєстрації засобів захисту рослин, переліку пестицидів, дозволених до використання в Україні, асортименту пестицидів, що завозяться в Україну, а також ліцензування діяльності, пов'язаної з їх виробництвом та реалізацією; Україну; ( Абзац восьмий частини першої статті 12 із змінами, внесеними згідно із Законом Законами N 1628-IV ( 1628-15 ) від 18.03.2004, N 3370-IV ( 3370-15 ) від 18.03.2004 19.01.2006 )
організація впровадження у практику захисту рослин досягнень науки, техніки та екологічно безпечних для людини і довкілля методів та заходів щодо захисту рослин;
забезпечення аналітичних досліджень щодо відповідності вимогам сертифікатів якості засобів захисту рослин, у тому числі пестицидів, які завозяться в Україну, а також додержання регламентів їх застосування;
виконання інших заходів щодо захисту рослин згідно з законодавством.
Головна державна інспекція захисту рослин проводить свою діяльність разом з іншими службами спеціально уповноваженого центрального органу виконавчої влади з питань аграрної політики, спеціально уповноваженим центральним органом виконавчої влади з питань охорони навколишнього природного середовища, державною санітарно-епідеміологічною службою України, місцевими органами виконавчої влади та органами місцевого самоврядування.
Нормативно-правові акти з питань захисту рослин, видані Головною державною інспекцією захисту рослин у межах його компетенції, є обов'язковими для виконання юридичними та фізичними особами.
( Стаття 12 із змінами, внесеними згідно із Законом N 1628-IV ( 1628-15 ) від 18.03.2004 )