Державні податкові інспекції підпорядковуються вищестоящим інспекціям і свою практичну діяльність здійснюють у тісній взаємодії з органами державного управління республіки та виконавчими комітетами Рад народних депутатів.
Державні податкові інспекції усіх рівнів координують свою роботу з фінансовими органами, банківськими установами, органами внутрішніх справ, суду, прокуратури, арбітражу, іншими контролюючими органами.