Обрання, переобрання Голови Агентства та його заступників відбувається шляхом таємного особистого голосування членів Агентства. Голова Агентства та заступники Голови Агентства повинні представляти різних суб’єктів подання, які пропонували своїх представників до складу Агентства.
Голова Агентства та два його заступники повинні представляти центральні органи виконавчої влади, Спільний представницький орган сторони роботодавців на національному рівні та Спільний представницький орган репрезентативних всеукраїнських об’єднань профспілок на національному рівні.
На посади Голови Агентства та його заступників не може бути призначено осіб, які займають посади державної служби або на яких поширюються обмеження щодо сумісництва та суміщення з іншими видами діяльності, передбачені Законом України “Про запобігання корупції”.
Повноваження Голови Агентства та його заступників можуть бути достроково припинені на письмову вимогу не менше восьми членів Агентства.