Обрання, переобрання Голови Агентства та його заступників здійснюється шляхом таємного особистого голосування членів Агентства. Голова Агентства та його заступники повинні представляти різних суб’єктів подання, які пропонували своїх представників до складу Агентства.
Голова Агентства та його заступники повинні представляти центральні органи виконавчої влади, Спільний представницький орган всеукраїнських об’єднань організацій роботодавців та Спільний представницький орган репрезентативних всеукраїнських об’єднань профспілок.
На посади Голови Агентства та його заступників не можуть бути призначені особи, які займають посади державної служби або на яких поширюються обмеження щодо сумісництва та суміщення з іншими видами діяльності, передбачені Законом України “Про запобігання корупції”.
Повноваження Голови Агентства та його заступників можуть бути достроково припинені на письмову вимогу не менше восьми членів Агентства.