Засідання Комісії відбуваються за необхідності на прохання однієї з держав-учасниць, але не рідше двох разів на рік, як правило, в місті Мінську. Організація роботи Комісії покладається на Робочу групу для організаційно-технічної підготовки і проведення засідань Ради глав держав і Ради глав урядів Співдружності Незалежних Держав.