Експертні органи зацікавлених Сторін утворюють міждержавну експертну групу по кожному об'єкту міждержавної експертизи. При цьому базовим експертним органом є орган Сторони, на території якої передбачається реалізація проекту будівництва, що становить взаємний інтерес для Сторін.
У разі реалізації проекту будівництва на території двох і більше Сторін базовий експертний орган визначається за взаємною згодою зацікавлених Сторін.