Координація взаємодії уповноважених (компетентних) органів з реалізації цієї Угоди здійснюється Комісією держав - учасниць Співдружності Незалежних Держав з використання атомної енергії в мирних цілях.
Під час підготовки та реалізації спільних проектів уповноважені (компетентні) органи в разі необхідності визначають узгоджений перелік об'єктів.