Комісія проводить свої засідання один раз в два роки, почергово в Україні і в Угорській Республіці. Строк проведення засідань узгоджуються Головами частин, не пізніше, ніж за місяць до дати проведення засідання.
З ініціативи Голови будь-якої з частин Комісії можна скликати надзвичайне засідання Комісії.
Робоча мова засідань Комісії - українська, угорська, російська.