Відомствами, відповідальними за реалізацію цієї Угоди є:
від Української Сторони - Міністерство охорони навколишнього природного середовища та ядерної безпеки України;
від Російської Сторони - Міністерство охорони навколишнього середовища і природних ресурсів Російської Федерації.