Міністерства і відомства, перелічені в пункті 1 статті 1 цієї Угоди, здійснюють оплату виконаних в їх інтересах військових міждержавних перевезень і пов'язаних з ними послуг транспортним організаціям.
Оплата військових міждержавних перевезень здійснюється відправниками (одержувачами) військових ешелонів, військових команд і варт за тарифами і правилами, діючими на видах транспорту України і Російської Федерації.
Оплата військових міждержавних перевезень осіб, що входять до складу військових формувань, та членів їх сімей, що прямують пасажирськими поїздами, здійснюється за готівку безпосередньо пасажирами.
При перевезенні військових вантажів транзитом через територію України і територію Російської Федерації оплата перевезень здійснюється через експедиторські фірми, з якими Міністерство оборони України, Міністерство внутрішніх справ України, Служба безпеки України, Управління урядового зв'язку України, Державний комітет у справах охорони державного кордону України і Міністерство оборони Російської Федерації, Міністерство внутрішніх справ Російської Федерації, Федеральна служба безпеки Російської Федерації, Федеральне агентство урядового зв'язку та інформації, Федеральна прикордонна служба Російської Федерації укладають відповідні договори.