Рішення Комісії мають характер рекомендацій і вносяться до протоколу засідання, який підписують Голови Частин Комісії. В протоколі можуть бути записані окремі позиції кожної з Сторін.
Рішення Комісії вступають в силу з моменту їх прийняття, якщо інше не записано в самих рішеннях.
У випадках, коли рішення за заявою однієї із Частин Комісії підлягає затвердженню її Урядом, Голови Частин відповідно інформують один одного про рішення свого Уряду.
Протоколи засідань складаються українською та білоруською мовами, причому обидва тексти мають однакову силу.