Доданий до вантажу дійсний фітосанітарний сертифікат не виключає права сторони, що імпортує, здійснювати карантинну перевірку вантажу з іншої країни та вживати необхідних захисних заходів у тому разі, якщо вантаж не відповідає фітосанітарним вимогам. У разі розбіжностей фітосанітарні Органи Договірних Сторін вирішують питання про факт зараженості вантажу на основі результатів паралельного огляду, здійсненого спільно методами, встановленими у своїх країнах.