Забезпечення виконання цієї Угоди Сторони покладають відповідно на Національне космічне агентство України (НКАУ) і Російське космічне агентство (РКА).
У межах цих повноважень НКАУ і РКА:
здійснюють планування основних робіт і заходів у рамках двосторонніх програм дослідження та використання космічного простору з залученням, у разі потреби, інших державних органів своїх країн;
сприяють розвитку співробітництва між заінтересованими міністерствами і відомствами, організаціями і підприємствами обох держав;
здійснюють контроль за провадженням усіх видів діяльності по проектах (роботах), передбачених відповідними двосторонніми програмами, і сприяють виконанню зобов'язань, взятих організаціями і підприємствами обох держав у рамках цієї Угоди;
узгоджують або затверджують контракти (договори), що укладаються замовниками, які представляють одну країну, з виконавцями (науковими і промисловими організаціями), які представляють іншу країну, і забезпечують контроль за належним виконанням цих контрактів (договорів).
Рішення та рекомендації щодо двосторонніх космічних програм і конкретних контрактів приймаються на нарадах керівників НКАУ і РКА, що проводяться не рідше одного разу на рік, як правило, почергово в кожній з країн.
У разі потреби для координації діяльності НКАУ і РКА можуть створювати спеціальні комісії та робочі групи.