Співробітництво між Сторонами здійснюється за такими основними напрямками:
- охорона атмосферного повітря, зниження викидів шкідливих речовин в атмосферу;
- охорона вод від забруднення, особливо басейнів рік Дніпро та Буг;
- відтворення лісосировинних ресурсів і охорона лісного фонду;
- проведення спільної експертизи проектів господарської діяльності в прикордонних районах;
- правові і економічні аспекти природокористування;
- вивчення біологічних і генетичних наслідків забруднення навколишнього середовища внаслідок антропогенного впливу;
- охорона флори і фауни, розвиток співробітництва між національними парками;
- охорона навколишнього середовища в процесі виробництва і переробки сільськогосподарської продукції;
- переробка, знешкодження і утилізація промислових і побутових відходів;
- контроль за транскордонними перевезеннями токсичних відходів;
- взаємне оперативне інформування про випадки, які створюють загрозу значного забруднення навколишнього середовища однієї з Сторін і про прогнози його розповсюдження;
- надання взаємної допомоги в подоланні наслідків промислових аварій або стихійних лих, що викликають забруднення навколишнього середовища;
- розробка маловідходних і безвідходних технологій і екологічно нешкідливих матеріалів, устаткування, механізмів і транспортних засобів з системами, що знижують забруднення;
- обмін природоохоронною інформацією;
- екологічна освіта і виховання.
Основні напрямки співробітництва можуть змінюватися і доповнюватися за взаємним узгодженням Сторін.