Компетентними Органами Договірних Сторін, які здійснюють координацію цієї Угоди є:
- від України - Міністерство сільського господарства та продовольства;
- від Словацької сторони - Міністерство сільського господарства та продовольства Словацької Республіки.
Компетентні органи Договірних Сторін будуть здійснювати безпосередній зв'язок з метою виконання цієї Угоди, а також мають право укладати міжвідомчі Угоди.