Основними завданнями діяльності Змішаної Комісії будуть наступні:
a) розгляд програм економічного, промислового та науково-технічного співробітництва в галузях, що представляють взаємний інтерес;
b) сприяння створенню відповідних умов для надання кредитів та забезпечення фінансування економічного, промислового і науково-технічного співробітництва;
c) розробка пропозицій та забезпечення виконання погоджених програм підтримки малого та середнього підприємництва;
d) сприяння створенню відповідних умов, що дають можливість співпрацювати господарюючим суб'єктам обох держав у міжнародних виставках і ярмарках, що проводяться на території держави однієї з Договірних Сторін, а також для започаткування співробітництва Торгово-промислових палат держав обох Договірних Сторін;
e) співробітництво з розвитку екологічно безпечних систем інфраструктури, а саме в галузях:
- енергетики;
- автомобільних та залізничних мереж;
- морських та річкових транспортних мереж;
- авіаційного транспорту;
- телекомунікацій;
- збору та обробки промислових та побутових відходів;
- покращення очистки води;
f) співробітництво в сфері охорони навколишнього природного середовища та екологічної безпеки, у цьому зв'язку буде прийматися до уваги раціональне використання природних ресурсів, а також розширення частки екологічно чистих виробництв відповідно до діючих або таких, що розробляються, глобальних та регіональних програм розвитку промисловості;
g) розробка пропозицій та прийняття заходів для забезпечення безпеки та стабільності поставок електричної енергії, нафти та природного газу, а також залучення потенційних інвесторів, при цьому надаватиметься особлива увага питанням використання та передачі електричної енергії, транспортування газу та нафтопродуктів;
h) розробка пропозицій та застосування заходів, спрямованих на підвищення рівня безпеки атомних електростанцій відповідно до міжнародно визнаних стандартів ядерної безпеки;
i) співставлення статистичних даних держав Договірних Сторін;
j) аналіз стану виконання міжурядових Угод між Україною та Словацькою Республікою.
Змішана Комісія буде сприяти розвитку коопераційних відносин та інших форм виробничого співробітництва.