Координацію і контроль за виконанням цієї Угоди здійснюють компетентні органи:
- з Української Сторони - Міністерство палива та енергетики України;
- з Російської Сторони - Міністерство енергетики Російської Федерації.
Уповноваженими організаціями Сторін з реалізації цієї Угоди є:
- з Української Сторони - Відкрите акціонерне товариство "Укртранснафта";
- з Російської Сторони - Відкрите акціонерне товариство "АК "Транснефть".
У разі зміни своїх компетентних органів і уповноважених організацій Сторони невідкладно інформують про це одна одну дипломатичними каналами.