Сторони зобов'язуються вживати у відповідності з законодавством своїх держав усіх заходів для запобігання проникненню на території України та Киргизької Республіки з експортним або транзитним підкарантинним матеріалом карантинних організмів.
Кожна партія підкарантинного матеріалу, що ввозиться з території держави однієї Сторони на територію держави іншої Сторони, повинна супроводжуватися фітосанітарним сертифікатом, який видає державна служба з карантину рослин країни-експортера. Сертифікат повинен засвідчувати, що підкарантинний матеріал відповідає фітосанітарним нормам, які пред'явлені країною-імпортером у карантинному дозволі на імпорт.
Витрати за видачу фітосанітарного сертифіката та карантинного дозволу на імпорт несе власник вантажу згідно з прийнятими в державах Сторін тарифами.
Компетентні органи Сторін залишають за собою право при закупівлі окремих партій підкарантинного матеріалу виставляти додаткові умови стосовно фітосанітарного стану такого матеріалу (знезараження, нова тара, відсутність сторонніх домішок, грунту, відсутність кори, промивання, герметичність та ін.). В цих випадках попередній контроль при експорті підкарантинних матеріалів може здійснюватись на території країни-експортера спільними зусиллями карантинних інспекторів держав обох Сторін.
Кожна партія підкарантинного матеріалу, що перевозиться транзитом через територію держави однієї Сторони на територію держави іншої Сторони, повинна супроводжуватися фітосанітарним сертифікатом.