Для реалізації і координації положень цієї Угоди компетентними органами Договірних Сторін є:
від української сторони - Державна ветеринарна та фітосанітарна служба України;
від азербайджанської сторони - Державна служба фітосанітарного нагляду при Міністерстві сільського господарства Азербайджанської Республіки.