Для ефективного функціонування системи, а також погодження нормативної правової бази медичного страхування громадян України і громадян Російської Федерації, які тимчасово знаходяться на території держави другої Сторони, створюється Координаційна рада з питань медичного страхування громадян України і громадян Російської Федерації (надалі - Координаційна рада). До складу Координаційної ради входять представники органів, що відповідають за організацію надання медичної допомоги на території держав у рамках даної Угоди, і уповноважені Сторонами страхові організації.
Органом, що відповідає за організацію надання медичної допомоги в рамках даної Угоди на території України, є Міністерство охорони здоров'я України. Органом, що відповідає за організацію надання медичної допомоги в рамках цієї Угоди на території Російської Федерації, є Міністерство охорони здоров'я Російської Федерації.
Медичне страхування громадян України, які тимчасово знаходяться в Російській Федерації, і громадян Російської Федерації, які тимчасово знаходяться в Україні, здійснюється страховими організаціями, уповноваженими Сторонами.