Відповідні протоколи між Сторонами визначають:
- зміст та форми співробітництва між Сторонами при здійсненні ними конкретних робіт у тому числі проектів, що здійснюються відповідно до міжурядових угод між Україною та Чеською Республікою,
- умови надання допомоги щодо організації та проведення державного регулювання безпеки та радіаційного захисту при використанні ядерної енергії,
- умови та порядок надання експертних та інших послуг.