Комісія є постійно діючим органом, що збиратиметься для проведення чергових засідань почергово в Україні та Республіці Перу, як правило, раз на рік у терміни, які погоджуються відповідними міністерствами.
З Української Сторони Головою комісії призначається представник відповідного міністерства або іншого центрального органу виконавчої влади, з Перуанської Сторони - представник Міністерства зовнішньої торгівлі та туризму.
Комісія може створювати робочі органи ad hoc (підкомісії, робочі групи, секретаріати тощо).
У засіданнях Комісії за попередньою згодою Договірних Сторін можуть брати участь експерти, а також представники приватного сектору.
Договірна Сторона, на території якої відбуватимуться засідання Комісії, виконуватиме функції її секретаріату.
Комісія може збиратися на позачергові засідання за пропозицією однієї з Договірних Сторін, місце і дата яких визначаються за взаємною згодою.
Витрати, пов'язані з організацією засідання Комісії та діяльністю робочих органів ad hoc, бере на себе Сторона, на території якої відбуваються зазначені заходи.
Країна, яка направляє своїх представників для участі в засіданнях Комісії або її робочих органів ad hoc, бере на себе всі витрати, пов'язані з їх відрядженням та перебуванням в іншій країні.