Бюджет ЧЕС складається з фінансових внесків держав-членів, що визначаються згідно з відповідними резолюціями Ради.
Бюджет затверджується та перевіряється щорічно. Фінансовий рік починається 1 січня та закінчується 31 грудня. Невиконання фінансових зобов'язань подається на розгляд Ради.