Основними завданнями Комісії є:
сприяння забезпеченню координації дій органів виконавчої влади щодо забезпечення прав української національної меншини в Румунії та румунської національної меншини в Україні;
організація розроблення та здійснення заходів щодо співробітництва між Україною та Румунією з метою забезпечення прав національних меншин;
розроблення пропозицій щодо сприяння створенню необхідних соціально-економічних та інших умов для збереження і розвитку етнічної, культурної, мовної та релігійної самобутності національних меншин;
розроблення пропозицій щодо визначення шляхів, механізму та способів вирішення проблемних питань, удосконалення нормативно-правової бази щодо забезпечення прав української національної меншини в Румунії та румунської національної меншини в Україні.