Для реалізації своїх завдань Інститут:
виконує наукові дослідження та передає одержані результати до Ради національної безпеки і оборони України;
розробляє за дорученням Ради національної безпеки і оборони України та за власною ініціативою пропозиції щодо вирішення проблем національної безпеки України у стосунках з Російською Федерацією;
координує дослідження, що проводяться іншими науково-дослідними установами, з питань, що входять до його компетенції;
безкоштовно одержує необхідну інформацію від державних органів та організацій - співвиконавців робіт;
здійснює підготовку наукових кадрів через аспірантуру та забезпечує підвищення кваліфікації співробітників;
надає систематичну допомогу в роботі молодим спеціалістам, працівникам, які навчаються в аспірантурі та учбових закладах без відриву від виробництва, створює необхідні умови для поєднання навчання з роботою та забезпечує надання їм пільг, передбачених чинним законодавством;
організовує наукові конференції, наради, семінари з найважливіших проблем українсько-російських відносин;
за результатами досліджень готує до видання відповідні матеріали;
аналізує стан досліджень у зарубіжних державах, підтримує творчі зв'язки та здійснює співробітництво із зарубіжними установами і вченими з найважливіших проблем українсько-російських відносин, створює спільні наукові колективи, здійснює обмін спеціалістами та результатами наукових робіт і публікаціями;
захищає пріоритет виконаних у його підрозділах досліджень;
надає науково-методичну допомогу галузевим організаціям, виконує на договірних засадах науково-дослідні роботи та здійснює експертизи наукових проектів, у разі потреби залучає наукові установи та окремих фахівців до виконання найважливіших досліджень.