1. Договірні Сторони управляють видами флори й фауни для їхнього підтримання в сприятливому для збереження стані.
2. Протягом трьох років з моменту набуття чинності цим Протоколом Договірні Сторони складуть перелік видів флори й фауни, яким загрожує знищення, а також видів, які є критичними для функціонування екосистем, і нададуть таким видам охоронний статус.
3. Договірні Сторони регулюють, а в разі необхідності заборонять, діяльність, шкідливу для таких видів чи їхніх середовищ існування, і здійснюють управління, планування та інші заходи для забезпечення відповідного охоронного режиму для таких видів.
4. Стосовно видів фауни, які підлягають охороні, Договірні Сторони будуть регулювати, а в разі необхідності заборонять:
a) ловлю, утримання чи знищення, комерційну торгівлю, транспортування та представлення на виставках для комерційних цілей таких видів, їхніх яєць, частин чи продуктів;
b) порушення спокою дикої фауни, особливо під час розмноження, сплячки чи міграції, а також у період інших біологічних стресів.
5. Договірні Сторони координують свої зусилля за допомогою двосторонніх чи багатосторонніх заходів, зокрема в разі необхідності за допомогою угод про захист і відновлення мігруючих видів, ареал яких поширюється на територію, до якої застосовується цей Протокол.
6. Стосовно видів флори, які підлягають охороні, їхніх частин та продуктів, Договірні Сторони регулюють, а в разі необхідності забороняють, усі форми порушення та знищення, зокрема збирання, зрізання, викорінення, володіння, комерційну торгівлю, транспортування та представлення таких видів на виставках для комерційних цілей.
7. Договірні Сторони докладуть усіх зусиль безпосередньо або через Консультативну групу з питань збереження біорізноманіття Чорного моря для консультування з країнами ареалу, що не є Договірними Сторонами Протоколу, для координації зусиль для управління та охорони видів, які зазначено в додатку 2.