Особовий склад спеціальних антитерористичних формувань проходить додаткову підготовку за програмами, розробленими компетентними органами Сторін за участю Центру, як на своїй національній навчальній базі, так і в навчальних центрах інших Сторін на договірній основі.
Спільна підготовка спеціальних антитерористичних формувань Сторін проводиться у ході проведення командно-штабних та оперативно-тактичних навчань, які організуються Центром. Сторони на основі взаємної домовленості можуть проводити спільні навчання спеціальних антитерористичних формувань і стажування представників іншої Сторони у підрозділах своїх компетентних органів.