З метою виконання положень цього Протоколу уповноважені митні органи Сторін встановлюють необхідні зв'язки між підпорядкованими їм підрозділами, що здійснюють митний контроль і митне оформлення енергоносіїв, та прикордонними митницями на спільному українсько-російському кордоні, у зоні діяльності яких розміщені вимірювальні комплекси та інше обладнання для здійснення фактичного контролю.
Сторони сприяють взаємному обміну інформацією з вузлів обліку енергоносіїв, розташованих на територіях своїх держав, в межах їх компетенції, встановленої національними законодавствами України та Росії.
Представники уповноважених митних органів Сторін, при необхідності, зустрічаються для обговорення питань, пов'язаних із реалізацією положень цього Протоколу.