1. На судноплавній частині р. Дунай прикордонні кораблі мають право плавати по головному навігаційному фарватеру, незалежно від проходження лінії державного кордону.
2. Плавання прикордонних кораблів в іншій частині прикордонних вод держав Сторін може відбуватися тільки в прикордонних водах держави Сторони, прапор якої несе прикордонний корабель, а за лінією кордону - тільки за згодою Сторін.
3. Під час плавання в прикордонних водах держав Сторін прикордонні кораблі дотримуються Основних правил плавання по р. Дунай та внутрішніх навігаційних шляхах р. Дунай, Конвенції про Міжнародні правила запобігання зіткненню суден на морі 1972 року ( 995_137 ) та інших міжнародних договорів, що регулюють судноплавство, учасниками яких є держави Сторін.
4. Прикордонні кораблі під час плавання у нічний час доби вмикають спеціальні вогні, а також розпізнавальні вогні: для Української Сторони - зеленого кольору, для Румунської Сторони - синього кольору.
5. Спосіб використання візуального та радіозв'язку, радіочастоти і позивні буде встановлено прикордонними властями протягом місяця з дня набрання чинності цим Протоколом.
6. Зброя, яка є на борту прикордонних кораблів, застосовується лише у своїй частині вод та в порядку, визначеному національним законодавством держав Сторін.
7. Спрямування зброї, яка є на борту прикордонних кораблів, у бік сусідньої держави забороняється.
8. Зброя, яка є на борту прикордонних кораблів, повинна бути розвернута в діаметральній площині корабля та закрита чохлами.
9. Під час плавання в прикордонних водах іншої держави заборонено вмикати сигнал бойової тривоги або проводити військові навчання.