Компетентні органи Сторін, у межах своєї компетенції, з урахуванням взаємних інтересів і відповідно до законодавства держав Сторін організовують і здійснюють співробітництво за такими напрямами:
1. Спільний аналіз обстановки, у тому числі характеру протиправної діяльності на державному кордоні та в пунктах пропуску через кордон, тенденцій її розвитку.
2. Опрацювання спільних пропозицій щодо заходів, спрямованих на зміцнення правопорядку на державному кордоні.
3. Проведення спільних заходів з метою запобігання або припинення скоєння злочинів на державному кордоні відповідно до планів, погоджених з керівниками Департаменту оперативної діяльності Адміністрації Державної прикордонної служби України та Оперативного управління Прикордонної служби Республіки Молдова.
4. Обмін інформацією у сфері боротьби з протиправною діяльністю через державний кордон.
5. Обмін досвідом роботи з питань протидії злочинним проявам на державному кордоні держав Сторін.