Проект ЯПУ містить розділ з основними положеннями щодо безпечного зняття з експлуатації ЯПУ. На етапі проектування виконуються аналіз і вибір проектних рішень з урахуванням безпечного зняття з експлуатації ЯПУ (вибір матеріалів з урахуванням мінімізації їх забруднення, накопичення та поширення радіоактивних речовин, мінімізації використання потенційно небезпечних речовин та інше).