Орган сертифікації під час виконання функцій, визначених цими вимогами, повинен забезпечувати свою незалежність та об’єктивність відповідно до вимог Закону.
Орган сертифікації зобов’язаний оцінювати наявність загроз своїй незалежності та об’єктивності, вживати належних заходів для їх усунення та не допускати існуючого або потенційного конфлікту інтересів відповідно до вимог Закону.
Орган сертифікації не повинен брати участі у підготовці та прийнятті управлінських рішень Агенції, пов’язаних із наданням підтримки у сільському господарстві.
Орган сертифікації не повинен надавати Агенції послуги, надання яких заборонено Законом, а також послуги, надання яких відповідно до Закону створює загрозу його незалежності та об’єктивності.