Управління територіями пріоритетного розвитку здійснюватиме орган управління територіями пріоритетного розвитку (далі - орган управління територіями), діяльність якого спрямовується і координується Кабінетом Міністрів України через Віце-прем’єр-міністра України - Міністра з питань реінтеграції тимчасово окупованих територій. Основні завдання органу управління територіями: забезпечення реалізації Стратегії через розроблення та реалізацію відповідних програм та проектів, координація зусиль усіх заінтересованих сторін (передусім учасників - резидентів), залучення різних джерел фінансування, не заборонених законодавством, управління територіями пріоритетного розвитку відповідно до визначених повноважень.