У період між загальними зборами Академії її роботою керує президія, що обирається строком на п’ять років. До складу президії входять президент Академії, перший віце-президент, віце-президенти, головний учений секретар Академії, академіки-секретарі відділень. Інші члени президії обираються з числа членів Академії таємним голосуванням простою більшістю голосів.
Кількість членів президії визначається загальними зборами Академії.
Рішення президії приймаються відкритим голосуванням простою більшістю голосів у разі присутності на загальних зборах не менш як 2/3 загальної кількості її членів і є обов’язковими для всіх членів Академії, працівників наукових установ та апарату президії Академії.