Вищим керівним органом Академії є загальні збори, в яких беруть участь її дійсні члени (академіки), члени-кореспонденти, почесні академіки та іноземні члени. На загальні збори запрошуються представники наукових установ і наукової та педагогічної громадськості, які користуються правом дорадчого голосу.