Вищим колегіальним органом громадського самоврядування Університету є конференція трудового колективу. Делегати конференції обираються на зборах колективів структурних підрозділів згідно з нормами представництва, визначеними вченою радою Університету. При цьому не менше ніж 75% від загальної чисельності делегатів конференції складають науково-педагогічні працівники Університету, решта - інші категорії працівників Університету.
До складу делегатів конференції за посадами входять: ректор, проректори, директори інститутів, декани, начальники управлінь, головний бухгалтер, керівники профспілкових організацій працівників Університету.
Конференція трудового колективу скликається не рідше одного разу на рік.