Вищим колегіальним органом громадського самоврядування Університету є конференція трудового колективу. Делегати конференції обираються на зборах колективів структурних підрозділів згідно з нормами представництва, визначеними вченою радою Університету. Не менш як 75 відсотків загальної чисельності делегатів конференції становлять науково-педагогічні працівники Університету, решту - інші категорії працівників Університету.
До складу делегатів конференції за посадами входять: ректор, проректори, директори інститутів, декани, начальники управлінь, головний бухгалтер, голова первинної профспілкової організації співробітників Університету та голова первинної профспілкової організації студентів Університету.
Конференція трудового колективу скликається не рідше одного разу на рік.