Здійснення моніторингу біологічного та ландшафтного різноманіття в рамках функціонування державної системи моніторингу довкілля забезпечується на таких рівнях:
1) національний (державний) рівень;
2) регіональний рівень (рівень області чи біогеографічного регіону, зокрема Карпат);
3) локальний (місцевий) рівень (рівень окремої територіальної громади, природоохоронної території, конкретного місця існування видів рослинного і тваринного світу, біотопу, оселища);
4) об’єктовий рівень (рівень окремих об’єктів моніторингу, перелік яких зазначено в пункті 5 цього Порядку).
Суб’єкти моніторингу біологічного та ландшафтного різноманіття вносять дані та інформацію, отримані на національному, регіональному, локальному та об’єктовому рівні, до інформаційно-аналітичних систем у сфері охорони біологічного та ландшафтного різноманіття, у сфері охорони, використання та відтворення рослинного світу та тваринного світу, сфері використання та охорони екомережі.