Достовірність даних може знижуватися на різних етапах процесу їх формування, таких як:
1) вибір лабораторій, що беруть участь в ДЕН;
2) відбір пацієнтів для отримання гемокультур;
3) транспортування і обробка зразків в лабораторії;
4) застосування різних методик визначення чутливості до протимікробних препаратів;
5) узагальнення і аналіз даних.