Контроль за діяльністю ЦОВВ здійснюється шляхом проведення планових та позапланових перевірок, за результатами яких можуть порушуватися питання щодо проведення ЦОВВ службових розслідувань та притягнення посадових осіб до дисциплінарної відповідальності (у разі необхідності).