Структура апарату центрального органу виконавчої влади -відповідального виконавця відповідно до Закону України "Про центральні органи виконавчої влади" та Положення про Міністерство фінансів України, затвердженого Указом Президента України від 08 квітня 2011 року № 446, затверджується керівником відповідного центрального органу виконавчої влади, а в разі його відсутності - особою, яка виконує його обов’язки, підписується керівником планово-фінансової служби і подається до Мінфіну. Структура апарату центрального органу виконавчої влади - відповідального виконавця розглядається структурними підрозділами і погоджується Міністром фінансів України або особою, яка виконує його обов’язки.