У разі підозри або виявлення невідповідності системи біологічної безпеки компартмента задекларованому статусу рішенням головного державного ветеринарного інспектора території, на якій він розташований, призупиняється окремий ветеринарно-санітарний статус та реалізація тварин, продуктів з них і кормів на експорт, а також:
1) у разі підозри щодо виявлення збудника хвороби, щодо якої застосовано компартменталізацію, вживаються заходи відповідно до вимог інструкції щодо профілактики та ліквідації цієї хвороби;
2) діагностика хвороби, щодо якої застосовано компартменталізацію, має здійснюватись відповідно до вимог інструкції щодо профілактики та ліквідації цієї хвороби;
3) у разі виявлення іншої заразної хвороби тварин оператор потужності невідкладно інформує територіальний орган компетентного органу;
4) проводиться епізоотичне розслідування для з’ясування причин виникнення хвороби. Територіальний орган компетентного органу призупиняє видачу ветеринарних документів на продукцію з цього компартмента. Відновлення видачі ветеринарних документів на експорт можливе винятково після підтвердження оператором потужності поновлення належного рівня біобезпеки та відновлення територіальним органом компетентного органу окремого ветеринарно-санітарного статусу щодо однієї або декількох хвороб.